ちょっと、そこ！チオシアン酸グアニジンのサプライヤーとして、私はしばしば、それが他のカオトロピック剤とどのように積み重なるかについて尋ねられます。それで、私はこのトピックに深く飛び込み、いくつかの洞察をあなたと共有すると思いました。
まず、カオトロピックエージェントが何であるかについてすぐに進みましょう。カオトロピック剤は、水素結合、ファンデルワールス力、疎水性相互作用などの非共有相互作用を妨害することにより、水や他の生体分子の構造を破壊する物質です。それらは生化学と分子生物学で非常に重要であり、タンパク質の変性、核酸抽出、細胞溶解などによく使用されます。
グアニジンチオシアネート：重い打者
グアニジンチオシアネート（GUSCN）は、最もよく知られているカオトロピック剤の1つです。それは白い水 - ch₅n₃・hscnの化学式を備えた可溶性固体です。それが非常に人気がある主な理由の1つは、その高いカオトロピック強度です。これは、生体分子の非共有結合を本当に台無しにする可能性があることを意味します。
核酸抽出では、Guscnはロックスターです。開いた細胞を壊し、ヌクレアーゼを不活性化するのに役立ちます。これは、貴重なDNAとRNAを噛むことができる酵素です。これを行うことにより、血液、組織、細胞などのさまざまなサンプルタイプから核酸を効率的に分離することができます。
Guscnのもう1つの素晴らしい点は、その溶解度です。高濃度で水に溶けることができます。これは、強力なカオトロピックソリューションを作成する必要がある場合に本当に役立ちます。この高い溶解度により、ラボで簡単に連携できます。
他のカオトロピック剤と比較します
尿素
尿素は別の一般的なカオトロピック剤です。化学式（nh₂）₂coがあります。尿素はGuscnと比較してカオトロピックではありません。タンパク質を変性させ、水素結合を破壊する可能性がありますが、その効果はそれほど強くありません。
核酸抽出の観点から、尿素はguscnほど効果的にヌクレアーゼを不活性化しません。これは、尿素を使用する場合、抽出プロセス中に核酸分解のリスクが高いことを意味します。また、尿素溶液はpHが低い傾向があり、核酸の安定性に問題を引き起こすことがあります。
グアニジン塩酸塩（技術グレード）
グアニジン塩酸塩（技術グレード）どちらもグアニジニウムイオンを持っているという点でGuscnに似ています。ただし、いくつかの違いがあります。
グアニジン塩酸塩（GUHCL）は、GUSCNと比較してリボヌクレアーゼ（RNASE）を不活性化するのに効果が低い。 RNaseは非常に安定しており、不活性化が困難であり、Guscnはこの点でより良い実績があります。これにより、RNAを特別に抽出する場合、Guscnはより良い選択になります。
溶解度の観点から、GUSCNはGUHCLと比較して、より濃縮された溶液を水に形成できます。これは、特定のアプリケーションに非常に強力なカオトロピック環境が必要な場合に有利です。
グアニジンスルファメート
グアニジンスルファメート別のグアニジンベースのカオトロピック剤です。 Guscnと比較して異なる陰イオンがあります。グアニジンスルファメートのスルファメート陰イオンは、その特性に影響を与える可能性があります。
グアニジンスルファメートは、一般にguscnよりもカオトロピックではありません。特に同じ濃度で、生体分子の構造を混乱させるのにそれほど効果的ではないかもしれません。いくつかの困難な - lyse細胞タイプのように、高強度のカオトロピック剤が必要なアプリケーションでは、guscnがより良い選択肢になります。
グアニジン炭酸塩
グアニジン炭酸塩また、カオトロピック剤のグアニジンファミリーの一部です。水に溶解すると、炭酸アニオンのために基本的な溶液を形成します。
この基本性は、一部のアプリケーションでは欠点になる可能性があります。核酸抽出では、基本的な環境がRNAの加水分解を引き起こす可能性があります。一方、Guscnはこの問題を抱えておらず、より中性のpH環境を維持することができます。これは、核酸の安定性に適しています。
アプリケーションと適合性
GUSCNと他のカオトロピック薬剤の選択は、実際に特定のアプリケーションに依存します。
特にRNAを分離する必要がある場合、幅広いサンプルタイプからの核酸抽出に取り組んでいる場合、Guscnが最善の策である可能性があります。ヌクレアーゼを不活性化し、強力なカオトロピック環境を作成する能力は、この目的に最適です。
タンパク質変性研究では、超強力なカオトロピック剤を必要としない場合、尿素または塩酸塩グアニジンが十分かもしれません。多くの場合、それらは安価で、より少ないアプリケーションでうまく機能します。
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参照
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- Sambrook、J。、およびRussell、DW（2001）。分子クローニング：実験室マニュアル。コールドスプリングハーバーラボラトリープレス。